Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAN1Q9Y2M0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAN1Q9Y2M0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAN1Q9Y2M0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FAN1Q9Y2M0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAN1Q9Y2M0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAN1Q9Y2M0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FAN1Q9Y2M0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAN1Q9Y2M0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.2 ms