Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLCA2Q9UQC9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA2Q9UQC9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA2Q9UQC9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms