Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MED23Q9ULK4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MED23Q9ULK4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MED23Q9ULK4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MED23Q9ULK4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms