Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH9Q9ULB4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH9Q9ULB4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH9Q9ULB4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms