Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GJD2Q9UKL4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJD2Q9UKL4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GJD2Q9UKL4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJD2Q9UKL4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms