Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDC23Q9UJX2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC23Q9UJX2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms