Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBD1Q9UJT1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBD1Q9UJT1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBD1Q9UJT1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms