Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PUF60Q9UHX1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PUF60Q9UHX1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PUF60Q9UHX1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PUF60Q9UHX1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms