Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUFIP1Q9UHK0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NUFIP1Q9UHK0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NUFIP1Q9UHK0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms