Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRRDQ9UH36 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRRDQ9UH36 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.7 ms