Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DKK4Q9UBT3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DKK4Q9UBT3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DKK4Q9UBT3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DKK4Q9UBT3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms