Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPASTQ9UBP0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPASTQ9UBP0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPASTQ9UBP0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms