Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CGNQ9P2M7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CGNQ9P2M7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CGNQ9P2M7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.6 ms