Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CXXC1Q9P0U4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CXXC1Q9P0U4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CXXC1Q9P0U4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CXXC1Q9P0U4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms