Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
C9orf78Q9NZ63 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
C9orf78Q9NZ63 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C9orf78Q9NZ63 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C9orf78Q9NZ63 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1062.7 ms