Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALKBH4Q9NXW9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALKBH4Q9NXW9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALKBH4Q9NXW9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms