Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A12Q9NXJ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A12Q9NXJ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A12Q9NXJ0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms