Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW75

GPATCH2, G patch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH2Q9NW75 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPATCH2Q9NW75 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPATCH2Q9NW75 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms