Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RLIMQ9NVW2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RLIMQ9NVW2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 853.2 ms