Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
EMILIN3Q9NT22 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN3Q9NT22 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms