Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS45Q9NRW7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VPS45Q9NRW7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS45Q9NRW7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms