Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTPS2Q9NRF8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTPS2Q9NRF8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms