Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSS2Q9NR19 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSS2Q9NR19 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms