Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRTAC1Q9NQ79 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTAC1Q9NQ79 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTAC1Q9NQ79 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRTAC1Q9NQ79 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms