Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB18Q9NP72 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB18Q9NP72 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms