Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CLSPNQ9HAW4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CLSPNQ9HAW4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms