Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC28A3Q9HAS3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC28A3Q9HAS3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC28A3Q9HAS3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms