Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
RETREG1Q9H6L5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RETREG1Q9H6L5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RETREG1Q9H6L5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RETREG1Q9H6L5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms