Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TAF1DQ9H5J8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TAF1DQ9H5J8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TAF1DQ9H5J8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms