Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF4Q9H2L5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RASSF4Q9H2L5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF4Q9H2L5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms