Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCL3Q9H2J4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCL3Q9H2J4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCL3Q9H2J4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCL3Q9H2J4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms