Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.661e-10■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-224ENST00000452065 996 ntTSL 510.27□□□□□ -0.771e-10■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-227ENST00000458564 420 ntTSL 39.9□□□□□ -0.821e-10■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-213ENST00000427007 459 ntTSL 39.7□□□□□ -0.861e-10■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 HDLBP-222ENST00000449504 566 ntTSL 56.96□□□□□ -1.31e-10■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 CTTN-212ENST00000527962 587 ntTSL 215.03■□□□□ -03e-9■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 CTTN-208ENST00000498223 523 ntTSL 310.58□□□□□ -0.723e-9■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 C1orf159-212ENST00000467751 2099 ntTSL 216.77■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.41■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 516.35■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 214.73□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.22□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.81□□□□□ -0.21e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 212.74□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 NFE2L1-210ENST00000580037 583 ntTSL 413.75□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 PRKAR1B-210ENST00000488474 617 ntTSL 313.42□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.434e-8■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SH3BP2-216ENST00000510193 407 ntTSL 311.92□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 419.14■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-229ENST00000590576 583 ntTSL 319.13■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-222ENST00000589070 582 ntTSL 317.42■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-241ENST00000591934 553 ntTSL 416.29■□□□□ 0.23e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-231ENST00000590595 569 ntTSL 315.04■□□□□ -03e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-217ENST00000587237 548 ntTSL 513.58□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-240ENST00000591833 576 ntTSL 413.48□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.094e-9■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.224e-9■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 KDM6B-204ENST00000571047 362 ntTSL 59.93□□□□□ -0.824e-9■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.72e-8■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 COL18A1-206ENST00000459895 588 ntTSL 311.85□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 RUSC1-AS1-201ENST00000443642 679 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-8■■■■■ 27.8
CSTF2TQ9H0L4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.788e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.193e-9■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.24■□□□□ 0.831e-25■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 CTSD-206ENST00000497544 783 ntTSL 218.46■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 CTSD-203ENST00000429746 690 ntTSL 316.12■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 CTSD-214ENST00000637937 1262 ntTSL 515.99■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 SSBP2-203ENST00000504174 632 ntTSL 521.87■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 SSBP2-208ENST00000507655 845 ntTSL 516.82■□□□□ 0.283e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 SSBP2-207ENST00000507472 582 ntTSL 315□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.353e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 SSBP2-219ENST00000515395 1398 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.883e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 SSBP2-205ENST00000505980 1521 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 SSBP2-212ENST00000509053 1534 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.183e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 SSBP2-206ENST00000506960 685 ntTSL 26.04□□□□□ -1.443e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 SSBP2-211ENST00000509013 709 ntTSL 55.75□□□□□ -1.493e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 SSBP2-210ENST00000508912 256 ntTSL 25.01□□□□□ -1.613e-7■■■■■ 27.7
CSTF2TQ9H0L4 GABRE-206ENST00000474932 430 ntTSL 55.03□□□□□ -1.61e-7■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.321e-10■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 12e-8■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 DNM2-212ENST00000588976 536 ntTSL 512.3□□□□□ -0.442e-8■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 DNM2-207ENST00000586939 551 ntTSL 411.32□□□□□ -0.62e-8■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.672e-8■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.742e-8■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 TMEM121-203ENST00000552019 366 ntTSL 517.85■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-233ENST00000476935 828 ntTSL 322.33■■□□□ 1.172e-11■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 GNAS-251ENST00000492907 790 ntTSL 37.95□□□□□ -1.143e-11■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 KCTD15-205ENST00000588637 571 ntTSL 516.71■□□□□ 0.275e-7■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 PPP2R5C-209ENST00000553890 492 ntTSL 310.75□□□□□ -0.696e-8■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 PPP2R5C-213ENST00000554504 448 ntTSL 35.19□□□□□ -1.586e-8■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 AKAP8-205ENST00000599883 860 ntTSL 517.91■□□□□ 0.464e-8■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 AKAP8-202ENST00000537303 1350 ntTSL 215.9■□□□□ 0.144e-8■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.484e-8■■■■■ 27.6
CSTF2TQ9H0L4 ZFX-207ENST00000459724 673 ntTSL 521.81■■□□□ 1.083e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ZFX-210ENST00000497813 475 ntTSL 515.16■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ZFX-205ENST00000419690 300 ntTSL 212.35□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ZFX-206ENST00000428571 600 ntTSL 212.35□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.23e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.573e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.623e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 KPNA4-202ENST00000469804 790 ntTSL 223.58■■□□□ 1.376e-8■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.316e-8■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ELMO2-213ENST00000469801 874 ntTSL 514.84□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ELMO2-208ENST00000460474 749 ntTSL 514.84□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ELMO2-201ENST00000290246 3669 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.533e-8■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ELMO2-204ENST00000396391 3574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.713e-8■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ELMO2-206ENST00000450812 1168 ntTSL 29.97□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ELMO2-218ENST00000497412 777 ntTSL 58.18□□□□□ -1.13e-8■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ELMO2-216ENST00000487583 653 ntTSL 57.27□□□□□ -1.253e-8■■■■■ 27.5
CSTF2TQ9H0L4 ELMO2-217ENST00000488853 1250 ntTSL 56.8□□□□□ -1.323e-8■■■■■ 27.5
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