Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
NLRP1Q9C000 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NLRP1Q9C000 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NLRP1Q9C000 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms