Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU1

PBX4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX4Q9BYU1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PBX4Q9BYU1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PBX4Q9BYU1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PBX4Q9BYU1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PBX4Q9BYU1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms