Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PARD6BQ9BYG5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PARD6BQ9BYG5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARD6BQ9BYG5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARD6BQ9BYG5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms