Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC46A2Q9BY10 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC46A2Q9BY10 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC46A2Q9BY10 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms