Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RSPO3Q9BXY4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RSPO3Q9BXY4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RSPO3Q9BXY4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RSPO3Q9BXY4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms