Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHF7Q9BWX1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHF7Q9BWX1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF7Q9BWX1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF7Q9BWX1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms