Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW5

TIPIN, TIMELESS-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPINQ9BVW5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TIPINQ9BVW5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TIPINQ9BVW5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TIPINQ9BVW5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TIPINQ9BVW5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TIPINQ9BVW5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TIPINQ9BVW5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIPINQ9BVW5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TIPINQ9BVW5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TIPINQ9BVW5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms