Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM62Q9BVG3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM62Q9BVG3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM62Q9BVG3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms