Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TUBGCP2Q9BSJ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP2Q9BSJ2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBGCP2Q9BSJ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP2Q9BSJ2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms