Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLSTN3Q9BQT9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLSTN3Q9BQT9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms