Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBM4BQ9BQ04 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBM4BQ9BQ04 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RBM4BQ9BQ04 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms