Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ELF4Q99607 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ELF4Q99607 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ELF4Q99607 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms