Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAT1Q99536 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VAT1Q99536 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAT1Q99536 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms