Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NMNAT3Q96T66 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NMNAT3Q96T66 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms