Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CRBNQ96SW2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CRBNQ96SW2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CRBNQ96SW2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms