Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODF3Q96PU9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF3Q96PU9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3Q96PU9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3Q96PU9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3Q96PU9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3Q96PU9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3Q96PU9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3Q96PU9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3Q96PU9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms