Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSSK3Q96PN8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSSK3Q96PN8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK3Q96PN8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms