Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NSMCE2Q96MF7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NSMCE2Q96MF7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NSMCE2Q96MF7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms